Jede Lokomotive auf der Modellbahn muss in RailControl korrekt konfiguriert werden, damit diese gesteuert werden kann.
Im Hauptbildschirm kann man über das Icon 
zur Konfiguration der Lokomotiven gelangen. Alternativ kann bei der ausgewählten Lokomotive das Icon 
gewählt werden.
Basisdaten
Name
Der Name einer Lokomotive ist eine eindeutige Identifikation. Derselbe Name kann nur ein Mal vergeben werden. Einige Zentralen verwenden den Namen auch als eindeutige Identifikation zur Synchronisation der Lokomotiv-Datenbank (z.B. Märklin CS2/CS3).
Zentrale
Sind mehrere Zentralen an RailControl konfiguriert, so muss die Zentrale ausgewählt werden, mir der die Lokomotive gesteuert werden soll. Ist nur eine Zentrale konfiguriert so wird das Auswahlfeld nicht angezeigt.
Protokoll
Unterstützt eine Zentrale mehr als ein Digital-Protokoll, so muss das Protokoll ausgewählt werden, mit der die Lokomotive gesteuert werden soll. Unterstützt die Zentrale nur ein Protokoll, so wird das Auswahlfeld nicht angezeigt.
Adresse
Die Digital-Adresse, mit der die Lokomotive gesteuert werden soll.
Zuglänge
Die Länge des Zuges, vorzugsweise in cm. Dies wird im automatischen Betrieb verwendet um zu entscheiden, ob ein Zug eine Fahrstrasse oder ein Zielgleis benutzen darf.
Antrieb
Der Antrieb des Zuges des Vorbilds. Dies wird im automatischen Betrieb verwendet um zu entscheiden, ob ein Zug eine Fahrstrasse benutzen darf.
Zugtyp
Der Typ des Zuges. Dies wird im automatischen Betrieb verwendet um zu entscheiden, ob ein Zug eine Fahrstrasse benutzen darf.
Funkionen
Je nach Decoder können einer Lokomotive bis zu 32 Funktionen zugeordnet werden. Gezählt wird immer ab null.
Typ
RailControl kennt zwei Funktionstypen: die Dauerfunktion und die Momentfunktion.
Die Dauerfunktion kann mit einem Klick eingeschaltet werden und mit einem zweiten Klick wieder ausgeschaltet werden. Für Licht, Fahrgeräusch, Rangiergang und weitere langandauernde Aktionen sollte dies gewählt werden.
Die Momentfunktion ist für die Dauer des Klicks aktiv. Dies ist für kurze Aktionen wie Horn, Entkuppeln, Sprachansagen oder Kransteuerung sinnvoll.
Symbol
In RailControl stehen diverse Symbole zur Auswahl.
Automatikbetrieb
Wendezug
Wenn der Zug in beide Richtungen fahren kann ist dies ein Wende- oder Pendelzug. Im Automatikbetrieb kann RailControl die Fahrtrichtung eines Wendezuges wechseln. Ist Wendezug nicht angewählt, so lässt RailControl den Zug nur in der Ursprünglichen Fahrtrichtung weiterfahren.
Maximale Geschwindigkeit
Die maximale Geschwindigkeit des Zuges kann hier eingestellt werden. Diese gilt dann auch für den manuellen Betrieb, jedoch nicht wenn die Geschwindigkeit von der Zentrale aus schneller gestellt wird.
Reisegeschwindigkeit
Dies ist die Geschwindigkeit, mit der im Automatikbetrieb üblicherweise gefahren wird.
Reduzierte Geschwindigkeit
Die reduzierte Geschwindigkeit wird eingestellt, wenn im Automatikbetrieb der erste Rückmelder der Fahrstrasse erreicht wird.
Kriechgeschwindigkeit
Die Kriechgeschwindigkeit wird im Automatikbetrieb eingestellt, wenn der zweite Rückmelder der Fahrstrasse erreicht wird.