En la pantalla principal se puede ir a la configuración de controles con el icono 
:
En el ejemplo arriba ya hay un control configurado con el nombre "Mi control".
Abajo hay un botton "Nuevo" para añadir más controles.
Normalmente solamente un control es necesario. Una maqueta ferroviaria grande puede utilizar controles dedicados para las locomotoras, para los desvios y para los retroseñales.
Actualmente RailControl soporte los controles abajo:
| Manufactor | Control |
| Arduino | DCC-EX (anteriormente DCC++EX anteriormente DCC++) |
| CAN-Digital-Bahn | CC-Schnitte 2.1 |
| Digikejis | DR5000 |
| ESU | ECoS/Central Station Reloaded |
| Fleischmann | Twin-Center |
| KM1 | System Control 7 |
| LDT | HSI-88 RS232 |
| Märklin | Central Station 2/3 con TCP (reciente) |
| Märklin | Central Station 2/3 con UDP (anticuado) |
| Märklin | Interface 6050/6051 |
| OpenDCC | Z1 |
| Roco | Z21/z21 |
| Tams | MasterControl |
| Tams | MasterControl 2 |
| Tams | RedBox |
| Uhlenbrock | Adapter 63120 |
| Uhlenbrock | Adapter 63820 |
| Uhlenbrock | Intellibox |
| Uhlenbrock | Intellibox II |